物理清洗意圖是清除大部分菌藻、污泥及軟垢。清洗前，讓閉式冷卻塔外循環水泵停運，在只開風機的情況下運轉2h，使散熱片黏泥干燥，使其失掉黏性，便于抖脫填料層中的垢。

物理清洗前，需將泵的人口和放水管人口塞住，防止渣子進人管道。操作時，用棍棒在填料片中挑動，讓干燥的垢破碎脫落，然后用高壓水槍對填料和盤管進行清洗。關于盤管只需沖洗潔凈浮塵，因為用高壓水槍清洗很費時間。即便將外面幾層銅管上的垢沖脫，里邊還是需化學清洗。